Le contexte débute quand Magnolia revient sur Earthland après avoir été aspirée par l'anima et propulsée vers Edoras. Le Royaume de Fiore semble retrouver une courte paix. Non loin de Magnoria, où se situe la guilde Fairy Tail, une autre guilde prospère. Il s'agit de Grimoire Heart, un regroupement de mages illégaux dont le but ultime est de ranimer le plus machiavélique des mages, Zeref. Grimoire Heart se fait connaître grâce à de nombreux assassinats et vols. Le conseil des mages du royaume commence tout juste à s'intéresser à ce problème, mais doit aussi faire face à des monstres apparus sur l'île de Galuna, aux Balkans du mont Yakobe et à des voleurs qui s'attaquent à Shirotsume. Nombreux sont les mages de Fairy Tail à s'occuper de ces problèmes qui persistent cependant toujours. De plus, quelques mages qui n'appartiennent à aucune guilde, surnommés «Ermites», commencent à se faire des renommées en voyageant en solitaire et en résolvant de nombreux problèmes. Tandis que la situation sur Fiore tente de s'apaiser malgré ces problèmes, une nouvelle menace surgit, bien plus effroyable que toutes les autres...